Разделение микробиома хадза и чимане сохраняется тысячелетиями.
Учёные проанализировали образцы кала 85 взрослых представителей чимане — коренного народа Боливийской Амазонии, занимающегося земледелием и сбором дикоросов. Образцы были собраны в 2009 и 2012–2013 годах; по ним восстановлены геномы бактерий около 1408 видов. Затем сравнение проведено с данными о микробах хадза, охотников‑собирателей из Танзании. Предки народов разошлись десятки тысяч лет назад, прямых контактов между ними не было.
Несмотря на это, 1231 вид бактерий, то есть 87,4% общих видов, встречается и у хадза. Около 60% общих видов (848) у жителей индустриальных стран встречаются редко или не встречаются вовсе. Чтобы понять, достались ли эти микробы обоим народам от общих предков или попали к ним позднее, исследователи сравнили генетические различия между бактериями одного и того же вида у чимане и хадза.
Выяснилось, что за последние примерно 5 тыс. лет бактериальные штаммы между двумя народами почти не передавались — у 545 из 636 видов следов такого обмена не обнаружено. По расчетам авторов, бактерии чимане и хадза в последний раз обменивались генетическим материалом около 17 тыс. лет назад. Для сравнения, у бактерий жителей Европы и Северной Америки этот срок составил около 1,1 тыс. лет, а у жителей Азии и Северной Америки — около 4,6 тыс. лет. Время разделения бактериальных популяций чимане и хадза примерно укладывается в период между выходом людей из Африки (60–70 тыс. лет назад) и заселением Америки (16–23 тыс. лет назад).
Нашлись и исключения. У некоторых бактерий, например Akkermansia muciniphila и Bacteroides ovatus, а также кишечной палочки, штаммы чимане и хадза оказались близки по структуре, как внутри каждого народа. Близкие родственники этих видов встречаются по всему миру, а сами виды чаще встречаются у жителей индустриальных стран. По мнению исследователей, такие бактерии попали к чимане и хадза сравнительно недавно, в результате контактов с другими народами.
Многие виды, общие двум народам, ранее относили к исчезающим бактериям, которых больше у хадза, чем у жителей индустриальных стран. Учитывая это, авторы предупреждают: утрата таких микробов может быть связана с повышенным риском хронических метаболических и воспалительных заболеваний. Повторное прибытие этих микробов могло бы помочь вернуть утраченные функции организма, однако такие шаги требуют этических обсуждений с местными общинами.
